Flödescytometri och Dublin Mountains

I fredags var det exakt en månad sen jag landade i Dublin vilket innebär att en tredjedel av mitt utbyte redan har passerat. Och det går ruskigt fort!

Flödescytometri


Den här veckan har jag undersökt mina celler med hjälp av en flödescytometer. Vid flödescytometri förs provet genom ett smalt, konformat munstycke samtidigt som en vätska förs i i samma riktning i hög hastighet runtom provet. Detta gör så att cellerna i provet tvingas igenom en smal kanal en och en. I kanalen bestrålas cellerna med laser och genom att avläsa hur laserstrålen splittras och passerar cellerna så kan man avgöra vad det är för celler. Resultatet ifrån flödescytometri får man i form av dotplots med forward scatter (FSC) på ena axeln och side scatter (SSC) på andra axeln. FSC talar om hur mycket av laserstrålens ljus som passerar cellen och är ett mått på cellens storlek. SSC talar om hur mycket av laserstrålens ljus som splittrats när den träffade cellen. Laserstrålen splittras när den träffar en cellkärna eller granula och används därför för att mäta just detta.

Dublin Mountains

I lördags besökte jag och några andra utbytesstudenter Dublin Mountains strax söder om Dublin. Bergen är inte några jättehöga berg och kallas därför ofta Dublin Hills. Den högsta toppen var “The Fairy Castle” (ett stenröse och inte ett slott som namnet antyder) på 537 meter. Från toppen ser man hela Dublin och även över till Howth som vi besökte förra veckan.

Vyn över Dublin ifrån bergen.

Howth & Saint Patricks Day

Den här veckan har jag spenderat min tid mest på cellodlingslabbet och i biblioteket. Cellerna växer och delar sig konstant vid de rätta förhållandena som tillgång till näring, rätt atmosfär och temperatur. Detta innebär också att näringen i mediet som jag ger cellerna så småningom tar slut och att det bildas skadliga restprodukter. Därför kräver cellerna sin beskärda tid, vissa cellinjer delar sig väldigt snabbt och behöver tas hand om varje-varannan dag, medan andra inte är lika snabba och klarar sig fler dagar utan att sås om. Just nu odlar jag en cellinje (HeLa-celler) som behöver sås om ungefär 2 gånger i veckan och en annan cellinje (A549) som behöver pysslas med varannan dag.

Att så om sina celler innebär att en andel av cellerna i en odlingsflaska förs över till en ny flaska med nytt medium och på så sätt kan cellerna fortsätta må bra med mer yta och ny näring. Som det kanske låter så blir cellerna lite som ens bebisar, man måste se till så dom får mat och att dom mår bra hela tiden 🙂

Howth

Jag och ett par andra utbytesstudenter från Sverige besökte Howth (rimmar på “both”) som ligger en 30 minuters tågresa norr om Dublin. Howth är känd för sina vackra klippor och för att i största allmänhet vara en kust-ort med allt vad det innebär. Blåsigt på sina fläckar, men med helt otroliga utsikter. Regnjacka är bra att ta med om man ska hit och den som har höjdskräck kanske gör bäst i att inte gå på stigarna allra närmast kanten. Vill också tipsa om att köpa churros på marknaden och att gå förbi Howth Castle som bara ligger några minuter promenad ifrån tågstationen. Perfekta resmålet för den som vill utforska Irland utan att resa för långt ifrån storstaden 🙂

På bilden syns “The Baily Lighthouse” vilkt är en fyr i södra änden av halvön.

Saint patricks Day

Jag vet inte om det har undgått någon att det i söndags (17 mars) var Saint Patricks Day (eller som lokalborna kallar det: “Paddys Day”). St. Patricks Day är Irlands nationaldag och är väldigt stort både i och utanför Irland. Det är verkligen en högtid för alla, stora som små. I Dublin hålls en parad som tar sig hela vägen från Spiran (the Spire) i norra delen av staden till Saint Patricks Cathedral i södra Dublin och består av dans, musik och diverse olika konstnärliga inslag. I år uppskattades det att det var ungefär 200000 parad-besökare, de allra flesta iförda någonting grönt enligt traditionen. Mitt första irländska nationaldag blev precis lika härlig som jag föreställt mig och allas humör var på topp, förhoppningsvis blir det fler resor hit över 17:e mars!

I väntan på paraden i Dublin..
Redo för att fira St. Patricks Day.

Teori

Den här veckan har liksom förra bestått till stor del av teoretiskt arbete för att förbereda mig på att skriva om projektet i min rapport. En typisk dag med teori spenderar jag mest tid på att läsa artiklar, gärna nya artiklar som är inne på lite liknande frågeställningar som jag har. Jag markerar viktiga delar i texten, skriver sammanfattningar och noterar vilka källor som är lämpliga till vilka delar av min rapport.

Cellodling

Jag har även börjat med lite praktiskt arbete i labbet för att bekanta mig med metoder som jag kommer använda mig av senare. Till exempel har jag påbörjat en cellodling av så kallade HeLa-celler, en mycket etablerad och tålig cellinje som används världen över. Cellodling är på olika sätt både väldigt noggrann och inte särskilt noggrann, till exempel är det jätteviktigt att arbeta aseptiskt för att inte kontaminera sina celler, sitt medium eller arbetsytan, däremot är det sällan någon mikroliter-precision när det ska tillsättas medium eller annat i särskilda volymer. Just med HeLa-cellerna så är det svårt att misslyckas eftersom dom är så tåliga, visserligen användbart, men å andra sidan måste man vara noggrann med avfallshantering så inga levande HeLa-celler hamnar där dom inte ska vara.

Den här bilden är tagen vid Wexford Street som ligger precis vid universitetet, det finns gott om restauranger och caféer och mataffärer av alla slag.